Günhan Börekçi, Osmanlı tarihi üzerine uzmanlaşmış bir tarihçidir. Lisans ve yüksek lisans eğitimini Boğaziçi Üniversitesi’nde (1991-1999) tamamlayan Börekçi, 2010 yılında Ohio State Üniversitesi’nden tarih alanında doktora derecesini almıştır. 

Temel araştırma ve ilgi alanları arasında; erken modern dönem Osmanlı siyasi, sosyal ve askeri tarihi, tarihsel ağ araştırmaları (HNR), el yazması çalışmaları ve karşılaştırmalı tarih yer almaktadır. 

Daha önce İstanbul Şehir Üniversitesi'nde tam zamanlı öğretim üyesi (2010-2017) ve Budapeşte ile Viyana’daki Central European University’de misafir öğretim üyesi (2017-2024) olarak görev yapmıştır. Ağustos 2024’te İbn Haldun Üniversitesi kadrosuna katılan Börekçi, halihazırda Tarih Bölümü Başkanı olarak görev yapmaktadır.